对于40岁男性功能障碍的治疗，应当首先进行全面的身体检查和医疗评估，以确定可能的原因和最合适的治疗方案。治疗选择可能包括以下几种：

1. 药物治疗：常用的药物包括磷酸二酯酶-5（PDE-5）抑制剂，如西地那非（万艾可）、他达拉非（伟哥）等，用于改善勃起功能。其他药物如曲酮、阿片类药物等也可能用于特定情况。

2. 心理治疗：心理因素在男性功能障碍中可能起到重要作用，因此心理治疗如认知行为疗法（CBT）、性治疗等可能是治疗的一部分。

3. 生活方式改变：包括戒烟、限制酒精摄入、改善饮食、增加运动等，有助于改善男性功能障碍。

4. 激光治疗和手术：对于某些情况，激光治疗或手术可能是必要的选择，如阴茎植入术等。

治疗方案应根据患者的具体情况和医生的建议进行个性化制定，避免自行选择治疗方法或过度使用药物，以免产生不良后果。在治疗过程中，定期随访和评估治疗效果是至关重要的。