长期服用奥美拉唑可能会导致一些副作用。这些副作用包括但不限于：消化系统问题，如腹泻、恶心、呕吐和胃痛；维生素和矿物质吸收不良，可能导致骨质疏松和骨折的风险增加；患上细菌感染的可能性增加，尤其是与C. difficile相关的感染；存在患肺炎、肾脏问题和心血管事件风险增加的报道，但与奥美拉唑之间的因果关系仍在研究中。需要强调的是，这些副作用的发生与个体情况和使用方式有关，不是每个人都会出现。任何长期使用药物前，都应咨询医生，以了解个人的风险和利益。