急性肾炎的主要病原体是细菌感染，其中以链球菌感染最为常见。链球菌是一类革兰氏阳性球菌，包括β-溶血性链球菌（Streptococcus pyogenes）和β-溶血性链球菌（Streptococcus agalactiae）。β-溶血性链球菌是引起急性肾炎最主要的病原体，特别是在儿童中更为常见。其他细菌也可能引起急性肾炎，包括金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）和大肠杆菌（Escherichia coli）等。除细菌外，病毒感染也可能导致急性肾炎，如腺病毒、流行性感冒病毒等。某些真菌和寄生虫也可能引发急性肾炎，但相对较少见。