同房后小腹疼痛的原因可能有以下几种：

1. 宫颈或子宫内膜的刺激：在性生活过程中，子宫颈或子宫内膜可能会受到刺激，导致轻微的疼痛感。特别是月经周期中期或接近月经时，子宫对刺激的敏感度较高。

2. 盆腔炎症：如果女性患有盆腔炎症（如宫颈炎、输卵管炎等），同房时可能引起小腹部位的疼痛。这种情况下，疼痛通常伴有异味分泌物、发热等症状。

3. 卵巢囊肿或其他妇科疾病：如卵巢囊肿、子宫肌瘤等疾病，在同房时也可能引发小腹疼痛。这类疼痛通常较为持续且可能伴随其他症状。

4. 性行为过于剧烈：如果性行为较为剧烈或姿势不当，可能导致盆腔部位的肌肉或韧带拉伤，引发短暂的疼痛感。

5. 怀孕初期：怀孕初期，由于子宫增大和激素水平变化，也可能在同房后出现轻微的小腹不适。

如果疼痛持续或加重，建议及时就医检查，确保没有潜在的健康问题。