生殖器长水泡且痒的原因可能包括以下几种情况：

1. 生殖器疱疹：这是由单纯疱疹病毒（HSV-1或HSV-2）引起的性传播感染。感染后，生殖器部位可能出现水泡、溃疡，伴有瘙痒、灼热感和疼痛。初次感染症状较重，之后可能会有周期性的复发。

2. 过敏反应：使用某些肥皂、洗剂、润滑剂或避孕套材料可能引起皮肤过敏，导致生殖器区域出现水泡和瘙痒。

3. 接触性皮炎：与过敏反应类似，接触某些刺激性物质（如洗衣粉残留、卫生用品）可能引发局部皮肤炎症，导致水泡和瘙痒。

4. 念珠菌感染：这是由念珠菌属真菌引起的感染。女性常见于阴道感染，男性也可能受到影响。症状包括瘙痒、红肿、水泡或白色分泌物。

5. 摩擦或机械损伤：穿着不合适的内衣或紧身裤，或过度的摩擦可能导致皮肤损伤，出现水泡和瘙痒。

确诊和治疗需要专业医疗人员的评估。建议出现症状后尽早就医，避免自行处理引发并发症。医生可能会进行体格检查、实验室检测（如病毒培养或血清学检测）以确定具体原因，并根据诊断结果提供相应治疗，如抗病毒药物、抗真菌药物或避免过敏源的建议。