怀孕时患有肾结石可能导致疼痛和其他并发症，因此应该及时就医。以下是处理这种情况的一般步骤：

1. 就医：立即就医，以便医生评估情况并制定适当的治疗方案。

2. 评估疼痛：医生可能会询问疼痛的性质、强度和持续时间，以及是否伴有其他症状。

3. 检查：医生可能会进行身体检查，并可能要求进行影像检查，如超声波、X光或CT扫描，以确认肾结石的位置和大小。

4. 疼痛管理：医生可能会建议使用安全的药物来缓解疼痛，但必须确保这些药物对怀孕安全。

5. 治疗：治疗方法包括药物治疗、尿路扩张或手术，具体取决于肾结石的大小和位置以及怀孕阶段。

6. 水分摄入：增加饮水量有助于排出结石，但应遵循医生的建议，避免过量饮水。

7. 饮食：遵循医生或营养师的建议，调整饮食以减少结石形成的风险。

怀孕时患有肾结石需要及时就医并遵循医生的建议，以确保母婴健康。