布拉氏酵母菌散通常被认为是一种相对安全的补充剂。个体对其可能产生不同的反应。已知的副作用包括：胃肠道不适（如腹泻、恶心、胃灼热）、过敏反应（如皮疹、荨麻疹、呼吸困难）、头痛和眩晕。长期或过量使用可能导致维生素B含量异常升高，尤其是维生素B2和B6，从而引发肝脏损伤。尽管如此，这些副作用并非每个人都会经历，而且通常是轻微的。如果出现严重不良反应，建议立即停止使用并就医。布拉氏酵母菌散的安全性较高，但个体差异和适度使用的重要性不可忽视。