双歧杆菌三联活菌胶囊的使用时间因个体情况和医嘱而异。通常情况下，建议在医生指导下使用，遵循医生的处方用法和用量。一般而言，治疗消化系统问题或维护肠道健康的标准疗程为数周至数月。对于长期维护和预防，可能需要持续服用，但具体时长需遵循医生的建议。不建议自行决定延长或缩短使用时间，以免影响疗效和健康。在使用过程中，如果出现不良反应或症状没有改善，应及时咨询医生。服用双歧杆菌三联活菌胶囊应根据个人情况和医嘱，遵循指导使用，以达到最佳效果。