中医对于自身免疫疾病的解释主要基于阴阳平衡和气血调和理论。中医认为，自身免疫疾病的发生与体内的阴阳失衡、气血不足或运行不畅密切相关。

阴阳失衡被认为是疾病的根本原因之一。当体内阴阳失衡，免疫系统可能会出现紊乱，导致自身免疫性反应。例如，阴虚火旺或阳虚寒凝等情况都可能引发不同类型的自身免疫疾病。

中医强调气血的作用。气血充盈、运行顺畅是维持健康的重要条件。气虚或血虚会使身体的抵抗力下降，进而诱发疾病。气滞血瘀也是重要因素，气滞指气的运行不畅，血瘀指血液循环障碍，这些都会引起免疫系统异常。

中医治疗自身免疫疾病通常采用整体调理的方法，强调扶正祛邪，即增强正气（身体的防御能力）并清除邪气（致病因素）。具体治疗手段包括中药、针灸、推拿、食疗等，旨在恢复体内阴阳平衡，调和气血，从而达到治疗和缓解症状的目的。

中医将自身免疫疾病视为体内阴阳失衡、气血失调的结果，通过整体调理恢复平衡以达到治疗效果。