枯草杆菌二联活菌胶囊是一种常用的益生菌产品，常见副作用相对较少。但是个体反应因人而异，可能会出现以下一些副作用：轻微的消化不适，例如腹泻、腹胀或胃部不适；过敏反应，如皮疹、瘙痒或呼吸困难。长期或过量使用益生菌产品可能导致肠道菌群失衡，引发其他问题。如果出现严重不良反应，应立即停止使用并咨询医生。建议在使用前咨询医生或药师，特别是对于孕妇、哺乳期妇女、婴儿和有慢性疾病的人士。对于枯草杆菌二联活菌胶囊或任何其他药物，如有不适或疑虑，应及时就医寻求专业建议。