阴茎里面长疙瘩可能由多种原因引起，其中包括但不限于以下几种：

1. 男性生殖器疣：由人类乳头瘤病毒（HPV）感染引起，通常呈软质、颜色各异的小疙瘩状。HPV是一种常见的性传播疾病，可通过性行为传播。

2. 脂肪粒：即表皮囊肿，是由于皮肤的脂肪堆积在毛囊周围形成的小囊肿。

3. 疖：也称为汗管囊肿，是毛囊和皮脂腺的感染，形成的囊肿，通常是由于细菌感染引起。

4. 疱疹：由单纯疱疹病毒（HSV）感染引起，通常呈水疱状，可在阴茎、会阴等部位出现。

5. 神经纤维瘤：一种良性的神经组织肿瘤，通常是由于神经纤维细胞增生引起，多数为单个小疙瘩，常见于表皮下组织。

请注意，这些只是可能的原因之一，具体病因需要通过医生的诊断和检查来确定。任何在阴茎内部发现的疙瘩都应引起注意，并及时就医。