男性肚子两侧疼痛可能由多种原因引起。常见原因包括消化系统问题，如胃溃疡、胆囊炎或胰腺炎；泌尿系统问题，如肾结石或泌尿道感染；肌肉或韧带拉伤；神经痛或神经炎等。腹股沟疝或阑尾炎也可能导致类似症状。若疼痛伴有其他症状，如发热、呕吐、排尿困难或血尿等，则可能需要及时就医。建议患者尽快就诊，医生会进行详细的询问和体检，并可能进行必要的检查，如血液检查、尿液分析、超声波或CT扫描等，以确定疼痛的具体原因，并制定相应的治疗方案。