阴茎根部比阴茎头部小是因为阴茎结构的特性所致。阴茎由海绵体和海绵体周围的阴茎海绵体组成。海绵体是一种能够充血的组织，负责勃起。阴茎头部主要由海绵体组成，这些组织可以在充血时膨胀，形成阴茎勃起。而阴茎根部则主要由阴茎海绵体组成，这些组织相对较少，因此在未勃起状态下通常较小。阴茎根部还包括睾丸、附睾等生殖器官，这些组织的存在也会影响到阴茎根部的大小。阴茎根部比阴茎头部小是由于阴茎结构和组织分布的生理特性所决定的。