控制生殖器疱疹的最好方法是通过医生开具的处方药物治疗，如抗病毒药物阿昔洛韦（Acyclovir）、磷酸阿昔洛韦（Valacyclovir）和长效磷酸阿昔洛韦（Famciclovir）。这些药物可缓解疱疹症状，减少疱疹的发作次数和持续时间。患者应避免与他人性接触以减少传播风险，使用避孕套也可以降低传播疱疹的可能性。保持良好的卫生习惯，定期检查和咨询医生也是管理生殖器疱疹的关键步骤。需要注意的是，以上措施可以帮助控制疱疹，但无法完全根治该病毒，因此患者需要长期定期监测和治疗。