阴茎根部出现小疙瘩可能是多种原因引起的，包括但不限于以下情况：

1. 男性生殖器皮肤病变，如湿疹、生殖器疱疹等。
2. 疣状软骨瘤，即由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的良性皮肤病变。
3. 毛囊炎，指毛囊周围的感染和炎症，可能由细菌、真菌或病毒引起。
4. 脂肪粒，即在皮下脂肪组织中形成的囊肿。
5. 浅表性静脉曲张，由于血管扩张和血流受阻引起。

建议您就诊于医生，进行详细的体格检查和必要的实验室检查，以确定病因并获得正确的诊断和治疗方案。