不孕不育男性进行检查的主要内容包括以下几个方面：

（1）身体检查：常规检查包括体型、毛发分布以及二次性征等方面。神经系统检查包括视野、嗅觉、肛门括约肌张力、会阴部感觉等方面。生殖系统检查包括阴茎、尿道外口、海绵体、前列腺、睾丸、输精管、精索静脉等方面。

(2) 精液检查：通常采用手淫方式收集精液，并可测定精液的颜色、量、酸碱度、黏稠度、总精子数、精子密度、形态和活力等指标。这也是最常见的检查项目。

(3)免疫学检查主要涵盖对血液和精液中的抗精子抗体的检测等内容。

(4) 内分泌检查包括测量血液中的睾酮、卵泡促进激素、黄体生成素、泌乳素和雌二醇等物质的含量。

另外，如果需要的话，需要进行细菌学检查、泌尿生殖系统超声检查、X射线检查、染色体检查以及睾丸细胞学检查等。