跑步时小腿后侧肌肉疼痛可能是由于以下原因引起的：

1. 不良跑姿：不正确的姿势可能会增加对小腿后侧肌肉的压力，导致疼痛。

2. 过度使用：长时间或过度运动可能导致肌肉疲劳和疼痛。

3. 缺乏热身：没有充分热身可能会使肌肉容易受伤。

4. 肌肉拉伤：在跑步过程中，如果肌肉受到拉伤或扭伤，会导致疼痛。

解决方法：

1. 调整跑步姿势：确保你的跑步姿势正确，避免过度踩地或脚步过大。

2. 适度休息：给小腿后侧肌肉充足的休息时间，避免连续剧烈运动。

3. 加强训练：通过逐渐增加跑步距离和速度来增强小腿后侧肌肉的耐力和力量。

4. 热身和拉伸：在跑步前进行热身运动，并在跑步后进行适当的拉伸，以减少肌肉疼痛的可能性。

5. 注意伤势：如果疼痛持续或加剧，应及时停止运动并寻求专业医疗建议，以避免进一步损伤。