跑步后小腿内侧肌肉疼可能是由多种因素引起的。这种疼痛可能是由于过度使用小腿内侧肌肉而引起的肌肉疲劳。跑步时，这些肌肉可能会承受较大的压力，导致疼痛和不适。不正确的跑步姿势或跑步鞋的选择可能会增加小腿内侧肌肉的负担，导致疼痛。缺乏足够的热身或拉伸运动也可能导致肌肉疼痛和不适。如果存在潜在的肌肉拉伤或损伤，跑步后小腿内侧肌肉疼痛也可能是其症状之一。建议采取适当的休息和放松措施，如冷热敷、按摩、适当的休息和拉伸运动，有助于缓解疼痛和促进康复。如果疼痛持续或加剧，建议咨询医疗专家进行进一步评估和治疗。