肾结核细菌培养阴性可能由于以下几个原因：

1. 前期抗生素使用： 患者在进行肾结核细菌培养前，可能曾接受过抗生素治疗，这可能抑制了细菌的生长，导致培养结果为阴性。

2. 细菌数量不足： 肾结核细菌的数量可能不足以在培养中产生可检测的生长，特别是在患者症状轻微或慢性感染的情况下。

3. 培养条件不适当： 培养条件如温度、培养基选择等可能不适合肾结核细菌的生长，影响了细菌的检出。

4. 非细菌性感染： 患者肾脏的感染可能是由于其他病原体引起，而不是肾结核细菌，因此培养结果为阴性。

5. 培养时间不足： 可能需要更长时间才能检测到肾结核细菌的生长，而当前的培养时间不够长。

肾结核细菌培养阴性的原因可能是多方面的，包括抗生素使用、细菌数量、培养条件和培养时间等因素的影响。在评估这种情况时，需要综合考虑患者的临床症状、既往治疗史及实验室检测的其他结果，以做出更准确的诊断和治疗计划。