当进行有氧运动时，身体会利用氧气来分解脂肪酸，产生能量供给肌肉活动。这一过程称为脂肪氧化。有氧运动的持续性和中低强度使得身体更倾向于利用脂肪作为能量来源，相比之下，高强度的运动更依赖于碳水化合物。

脂肪氧化的主要机理涉及脂肪酸在线粒体内被氧化分解为二氧化碳和水，释放出大量的能量。这个过程需要足够的氧气供应，并涉及多个酶的参与，包括脂肪酸转运蛋白、脂肪酸氧化酶等。运动过程中肌肉的收缩也会刺激脂肪酸的分解和氧化。

有氧运动通过增加氧气供应和促进脂肪氧化酶的活性来促进脂肪的分解和利用，从而消耗体内脂肪储备。