慢跑减少肌肉主要是因为长时间的有氧运动会导致肌肉蛋白质分解加速。慢跑是一种低强度、长时间的有氧运动，通过消耗体内的糖原和脂肪来提供能量。在这个过程中，身体会逐渐转向分解肌肉蛋白质来维持能量供给，从而导致肌肉量减少。

长期进行慢跑而不进行足够的肌肉训练，也会导致肌肉萎缩。肌肉需要持续的刺激和负荷才能保持或增长。如果只进行有氧运动而忽略了力量训练，肌肉很容易就会减少。

因此，要避免慢跑减肌肉，建议在慢跑的同时进行适量的肌肉训练，包括重量训练和抗阻训练，以保持肌肉量和身体的整体健康。