生殖器长疱可能是由多种原因引起的，包括病毒感染（如生殖器疱疹）、细菌感染、真菌感染或其他皮肤病变。治疗方法应根据具体原因而定，因此建议就诊于专业医生进行确诊和治疗。

一般情况下，医生可能会建议以下治疗方法：

1. 抗病毒药物：对于由病毒引起的生殖器长疱，如生殖器疱疹，医生可能会开具抗病毒药物，如阿昔洛韦（Acyclovir）或其他类似药物。

2. 抗生素：如果生殖器长疱是由细菌感染引起的，医生可能会开具抗生素药物来治疗感染。

3. 局部药物治疗：医生可能会建议使用局部药物，如抗真菌药物，用于治疗真菌感染引起的生殖器长疱。

4. 保持局部清洁和干燥：保持生殖器区域清洁干燥是治疗和预防生殖器长疱的重要措施之一。

需要注意的是，自行使用药物治疗生殖器长疱可能会导致不良后果，因此建议及时就诊于专业医生，根据医生的建议进行治疗。