运动后肌肉酸痛的主要原因是运动引起的微小肌肉损伤，这会导致肌肉组织发炎和疼痛。当进行高强度或新的运动时，肌肉会经历拉伸和收缩，这可能导致微小的肌肉纤维断裂。身体为修复这些微小损伤而释放炎症介质，促进修复和生长。这种炎症反应引起了疼痛和不适感，通常在运动后6到48小时内达到高峰，被称为延迟性肌肉酸痛（DOMS）。运动后肌肉酸痛也可能与乳酸堆积有关，尽管乳酸并非主要导致酸痛的原因。因此，正确的热身、逐渐增加运动强度和频率、充分休息以及饮食补充都可以减轻这种酸痛感。