十三味菥蓂丸是一种传统中药制剂，常用于治疗肾虚所致的腰膝酸软、遗精频数等症状。其副作用主要包括：1. 个别患者可能出现消化不良，如恶心、呕吐等症状；2. 长期服用可能导致腹泻或腹痛；3. 部分人可能对其中某些成分过敏，表现为皮肤瘙痒、红肿等过敏反应。十三味菥蓂丸作为一种药物，应慎用于孕妇、哺乳期妇女和儿童，以及有严重肝肾功能损害的患者。总体而言，十三味菥蓂丸在规定用量下，一般不会引起严重的副作用，但仍建议在医生指导下使用，特别是对于有慢性疾病或正在服用其他药物的患者。