孕期沙眼衣原体感染的治疗需要特别谨慎，以确保对胎儿的安全。沙眼衣原体感染主要通过性传播，会导致尿道炎、宫颈炎等症状，甚至引发孕期并发症如早产、流产等。

治疗主要以抗生素为主。美国疾病控制与预防中心（CDC）推荐以下几种药物：

1. 阿奇霉素：单剂量1克口服，效果显著且安全性较高。
2. 红霉素：每日4次，每次500毫克，疗程7天。虽然疗程较长，但对于某些个体可能更适合。
3. 阿莫西林：每日3次，每次500毫克，疗程7天，适用于对其他药物不耐受的孕妇。

需要注意的是，孕期不能使用四环素类抗生素，因为它们可能对胎儿骨骼和牙齿发育产生不良影响。

在治疗期间，性伴侣也需要进行检查和治疗，以避免交叉感染。治疗结束后应进行复查，以确保感染已完全清除。

预防措施也十分重要。包括定期产前检查，安全性行为教育，以及对高危人群进行筛查和早期干预。

孕期沙眼衣原体感染的治疗需在医生指导下进行，选择适当的抗生素，同时注重伴侣治疗和定期复查，以确保母婴健康。