运动减肥确实会消耗糖元。在进行有氧运动时，身体主要依赖糖元（即碳水化合物）和脂肪来提供能量。初期运动时，身体会首先消耗糖元，因为它是最容易被身体利用的能量来源。随着运动的持续，身体会逐渐转向更多地消耗脂肪，尤其是在长时间低强度的有氧运动中。因此，运动不仅可以帮助减肥，还可以增强心肺功能和肌肉耐力。但是，要注意的是，单纯依靠运动减肥可能效果有限，还需要结合合理的饮食控制才能达到最佳效果。